В мультфильме "Врата Штейна 0" действие разворачивается в альтернативной временной линии бета, где Ринтаро Окабэ, главный герой, сталкивается с последствиями своих временных путешествий. Он пытается спасти свою возлюбленную, но в результате трагических событий случайно становится причиной её гибели. Это событие оставляет глубокий след в его жизни, погружая его в мир страданий, посттравматического синдрома и чувства вины. В поисках утешения и способа справиться с потерей, Ринтаро узнаёт о существовании передовой программы, позволяющей загружать человеческое сознание в искусственный интеллект.
С удивлением он обнаруживает, что существует цифровая версия его погибшей девушки, что открывает перед ним новые возможности. Однако, возвращение к воспоминаниям о ней не приносит облегчения; напротив, оно вызывает ещё большее напряжение и внутренние конфликты. Ринтаро оказывается перед сложным выбором: продолжать жить в тени прошлого или попытаться изменить своё будущее, исследуя границы реальности и технологии. В этом эмоциональном и философском путешествии он сталкивается с вопросами о жизни, любви и том, что значит быть человеком. "Врата Штейна 0" погружают зрителей в захватывающий мир, где каждый выбор может изменить всё.