Четверо братьев-черепах, Донателло, Леонардо, Микеланджело и Рафаэль, всю свою жизнь провели в темных и затененных уголках нью-йоркских канализаций. Скрываясь от глаз людей, они обучались древнему искусству ниндзюцу, чтобы стать мастерами боевых искусств. Однако, устав от постоянной изоляции, братья решают отправиться на поверхность и попробовать жить как обычные подростки. Их новое существование становится настоящим испытанием, полным неожиданных приключений и сложных ситуаций.
На поверхности они знакомятся с Эйприл О’Нил, смелой и решительной девушкой, которая становится их верной подругой и союзником. Вместе они начинают расследовать таинственные события, происходящие в городе, и вскоре выходят на след опасного преступного синдиката, который контролирует улицы Нью-Йорка и имеет в своих рядах армию мутантов. Братья-черепахи сталкиваются с множеством врагов, но с помощью своих уникальных навыков и смекалки они готовы сразиться за справедливость. В их приключениях переплетаются дружба, смелость и борьба с предрассудками, ведь быть подростком — это не только весело, но и сложно.