В 1999 году на Землю падает гигантский метеорит, который оказывается инопланетным космическим кораблем под названием «Макросс». Сначала человечество готовится к встрече с его владельцами, но вместо ожидаемых гостей на планету вторгаются их заклятые враги — огромные инопланетяне Зентреди. Эти воинственные создания, обладающие колоссальной силой и мастерством в боевых искусствах, вскоре начинают атаковать Землю. В результате автоматизированная система корабля «Макросс» открывает огонь, что запускает масштабный конфликт между людьми и Зентреди.
Несмотря на их физическую мощь, пришельцы оказываются уязвимыми в культурном плане — они не понимают человеческие эмоции и ценности, такие как любовь и творчество. В этом контексте простая песня становится мощным оружием, способным воздействовать на Зентреди. В то время как на фоне войны разворачивается любовный треугольник между пилотом Ичидзё Хикару, его начальницей капитаном Хаясэ Мисой и начинающей певицей Линн Минмэй, человеческие чувства и искусство становятся ключом к победе. «Гиперпространственная крепость Макросс» — это не только история о войне, но и глубокая драма о любви и поиске смысла в хаосе.